在广袤的艾瑟兰大陆上，万物皆由灵魂之火维系。传说上古时期，一位名为“织梦者”的神祇用梦境编织了世界最初的形态，然而一场名为“黯潮”的灾变撕裂了现实与梦境的界限，无数灵魂碎片散落于时空裂隙之中。千百年后，大陆上诞生了被称为“追梦者”的特殊族群，他们天生能与残留的梦境碎片共鸣，通过探寻失落的记忆来修复世界的创伤。
故事的主角是一名失去过往记忆的年轻追梦者，他在一次意外中从古老的祭坛苏醒，只记得自己名为“凌”。凌发现自己的灵魂深处藏着一枚奇异的梦之印记，这枚印记能让他进入他人的梦境，也能穿越回远古的幻象之中。在旅途初期，他遇到了守护灵“小梦”——一只由纯净梦境凝结而成的光球，它既是向导也是伙伴，帮助凌解读那些被遗忘的记忆碎片。
随着探索的深入，凌逐渐发现自己的失忆并非偶然。他曾是织梦者麾下的“守夜人”，负责看守连接现实与梦境的“星门”。但在黯潮爆发时，为了封印吞噬灵魂的巨兽“噬梦者”，他不得不牺牲自己的记忆，将巨兽的核心封印在体内。如今封印逐渐松动，噬梦者的残响开始侵蚀周围生灵的梦境，导致人们陷入永恒的噩梦或失去情感。凌必须前往大陆的五大梦境领域——晨曦森林、暮光沙漠、永夜冰原、幻音群岛与深渊裂谷，收集散落的灵魂碎片，重铸封印之力。
在剧情推进中，凌会遭遇形形色色的角色：背负家族诅咒的骑士“艾伦”，他的梦境中藏着祖先与噬梦者交易的秘密；擅长治愈却被噩梦困扰的祭司“艾琳”，她的记忆碎片揭示了织梦者消失的真相；还有神秘的反派“影”，他自称是噬梦者的化身，试图利用凌的印记打开星门，让黯潮重临世界。这些角色的故事与主线交织，共同构建出“灵魂羁绊”与“牺牲与救赎”的核心主题。
《魂之追梦》的世界观强调“记忆是灵魂的锚点”。每个梦境领域都对应一种核心情感：晨曦森林代表希望，暮光沙漠象征遗忘，永夜冰原映射孤独，幻音群岛承载思念，深渊裂谷则隐藏着绝望。玩家在探索过程中不仅需要战斗解谜，更要通过解读环境中的碎片化叙事，拼凑出完整的历史脉络。例如在暮光沙漠中，一座废弃的神庙壁画描绘了织梦者与噬梦者的宿命对决，而凌通过进入神庙守护者的梦境，才能看到那场战斗的真实结局——织梦者并非被击败，而是主动化为星辰，以自身存在封锁了星门。
最终，凌必须面对一个抉择：是彻底消灭噬梦者，让世界恢复平静但牺牲所有追梦者的能力；还是接纳噬梦者的碎片，成为新的“守梦者”，在永恒的痛苦中守护梦境与现实的平衡。这个开放式结局呼应了游戏“追梦”的主题——真正的勇敢并非战胜黑暗，而是学会与黑暗共存，并在记忆中寻找继续前行的力量。
整个背景故事通过层层递进的悬念、情感饱满的支线以及宏大的神话设定，为玩家提供了一个沉浸式的幻想世界。无论是灵魂碎片的收集机制，还是与NPC梦境相连的羁绊系统，都旨在让每一位玩家感受到：每一次追寻，都是对自我存在的重新定义。